Centro de Investigación en Biotecnología (CEIB)

Laboratorio de Biología Molecular de Hongos

Laboratorio de Biología Molecular de Hongos

 

Área de Estudio

Los hongos y su potencial en la biotecnología: biorremediación, biocombustibles y sistemas de expresión heteróloga, promoción del crecimiento vegetal y control biológico por hongos y bacterias.

Ámbito de trabajo

Los intereses de nuestro laboratorio tienen en común, el aislamiento de genes de hongos (principalmente) con interés biotecnológico, en particular aquellos que permiten mejorar los procesos de biorremediación y los involucrados en la degradación de celulosa para su uso posterior en la producción de etanol como fuente energética alternativa al uso del petróleo. La producción de las enzimas aisladas de los hongos se lleva a cabo eficientemente y a bajos costos al utilizar sistemas de expresión más sencillos, como las levaduras. Con esta línea de investigación, pretendemos generar cepas de diferentes levaduras (Saccharomyces cerevisiae, Pichia pastoris, Kluyveromyces lactis, etc.) que tengan la capacidad de llevar a cabo la expresión de las enzimas de interés.
La metagenómica (es el estudio del conjunto de genomas de microorganismos contenidos en una muestra de un nicho ecológico determinado), permite superar la limitación de no poder cultivar la mayoría de estos organismos de un ambiente en particular para el aislamiento y la caracterización de su material genético. Se ha generado una metagenoteca a partir de bagazo de caña de azúcar. A través de la bioprospección se pretende buscar nuevas herramientas con potencial biotecnológico en las áreas de la biorremediación y biocombustibles.
Por último, se han aislado hongos y bacterias capaces de promover el crecimiento vegetal de especies de interés agrícola. Estos microorganismos también confieren a las plantas tolerancia a estrés abiótico y resistencia a patógenos de plantas.

Líneas de generación del conocimiento

  • Biorremediación de ambientes contaminados y tratamiento de residuos

Integrantes del laboratorio

 

Dr. Jorge Luis Folch Mallol - jordi@uaem.mx

Profesor-Investigador, Responsable

Dra. Ma. del Rayo Sánchez Carbente - maria.sanchez@uaem.mx

Profesor-Investigador,

M en B. Ma. del Rocío Rodríguez - rocio.rodriguez@uaem.mx

Técnico académico

 

Estudiante de:

Irán Tapia Vázquez

Doctorado en Ciencias Naturales

Richa Mehta

Doctorado en Ciencias Naturales

Ricardo Sánchez Cruz

Doctorado en Ciencias Naturales

Dorcas Zúñiga Silgado

Doctorado en Ciencias Naturales

Yordanis Pérez Llano

Doctorado en Ciencias

Ella Caridad Rodríguez Pupo

Doctorado en Ciencias

Giovanni Salazar Ramírez

Maestría en Biotecnología

María Fernanda Gaitán Rodríguez

Maestría en Biotecnología

Adriana Elizabeth Ávila Hernández

Maestría en Biotecnología

César Alejandro Arreguín Pérez

Maestría en Biotecnología

Magdalena Urzúa

Maestría en Biotecnología

Candelario Rodríguez Serrana

Maestría en Biotecnología

Martín Romualdo Ide Pérez

Maestría en Biotecnología

Daniel Hernández Fuentes

Maestría en Biotecnología

Laura Torres Juárez

Maestría en Biotecnología

Diana Fernanda Barreto Álvarez

Tesista de licenciatura

Marisol Arroyo

Tesista de licenciatura

Héctor Franco

Tesista de licenciatura

 

Proyectos

  • Producción de etanol a partir de residuos lignocelulósicos. Financiamiento CONACyT Ciencia Básica 48256 Z.
  • Bioremediación de suelos y aguas contaminadas.
  • Sistemas de producción heteróloga de proteínas.
  • Biodiversidad y bioprospección.
  • Microorganismos promotores del crecimiento vegetal

Publicaciones

  • Valderrama Brenda, Paredes-Valdez Guadalupe, Rodríguez Rocío, Romero-Guido Cynthia, Martínez Fernando, Martínez-Romero Julio, Guerrero-Galván Saúl, Mendoza-Herrera Alberto and Jorge Luis Folch-Mallol. (2016). Assessment of non-cultured aquatic fungal diversity from different habitats in Mexico. Revista Mexicana de Biodiversidad. 87., 18-28 ISSN:1870-3453.
  • Ramón Alberto Batista-García, Rocío Casasanero, Alberto Alvárez-Castillo Stephen A. Jackson, Alan D. W. Dobson and Jorge Luis Folch-Mallol. (2016). Prokaryotic diversity from the culture-independent taxonomic analysis of a sugarcane bagasse metagenome. Merit Research Journal of Microbiology and Biological Sciences Vol. 4(1) pp. 022- 038. ISSN:2408-7076
  • Edgar Balcázar-López, Luz Helena Méndez-Lorenzo, Ramón Alberto Batista-García, Ulises Esquivel-Naranjo, Marcela Ayala, Vaidyanathan Vinoth Kumar, Olivier Savary, Hubert Cabana, Alfredo Herrera-Estrella and Jorge Luis Folch-Mallol. Xenobiotic compounds degradation y heterologous expression of a Trametes sanguineus laccase in Trichoderma atroviride. (2016). PLoS ONE 11(2): e0147997. doi:10.1371/journal.pone.0147997       ISSN 1932-6203
  • Batista-García Ramón Alberto, Sánchez-Carbente María del Rayo, Talia Paola, Jackson Stephen A, O`Leary Niall D., Dobson Alan D. W. and Folch-Mallol Jorge Luis. (2016). From lignocellulosic metagenomes to lignocellulolytic genes: trends, challenges and future prospects. Biofuels, Bioproducts & Biorefining, 10 (6), pp 864-882. ISSN: 1932-1031
  • Barrera Iliana, Guzmán Nydia, Peña Erika, Tania Vázquez, Cerón Francisco, Folch Jorge, Salazar José Amador Honorato and Aburto Jorge. (2016). Ozonolysis of alkaline lignin and sugarcane bagasse: structural changes and their effect on saccharification. Biomass and Bioenergy, 94 (2016) 167e172. ISSN: 0961-9534
  • Sánchez-Carbente María del Rayo, Batista-García Ramón Alberto, Sánchez-Reyes Ayixón, Escudero-Garcia Angela, Morales-Herrera Catalina, Cuervo-Soto Laura Inés, French-Pacheco Leidys, Fernández-Silva Arline, Amero Carlos, Castillo Edmundo and Jorge Luis Folch-Mallol. (2017). The First description of a Hormone-Sensitive Lipase from a Basidiomycete: Structural Insights and Biochemical Characterization Revealed Bjerkandera adusta BaEstB as a Novel Esterase. Microbiology Open. 00:e00463. https://doi.org/10.1002/mbo3.463. ISSN: 2045-8827
  • Batista-García Ramón Alberto, Sutton Thomas, Jackson Stephen A., Tovar-Herrera Omar Eduardo, Balcázar-López Edgar, Sánchez-Carbente María del Rayo, Sánchez Reyes Ayixon, Dobson Alan D. W. and Jorge Luis Folch-Mallol. (2017) Characterization of Lignocellulolytic Activities from Fungi Isolated from the Deep-Sea Sponge Stelletta normani. PLoS ONE. http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0173750. 1932-6203. ISSN: 1932-6203
  • Sánchez-Reyes A., Batista-García R., Valdés-García Gilberto, Ortiz Ernesto, Perezgasga Lucía, Zárate-Romero Andrés, Pastor Nina, Folch-Mallol Jorge Luis. (2017). A Family 13 thioesterase isolated from an activated sludge metagenome: insights into aromatic compounds metabolism. PROTEINS, structure, function and Bioinformatics. doi:10.1002/prot.25282. ISSN: 1097-0134
  • Batista-García Ramón Alberto, Kumar Vaidyanathan Vinoth, Ariste Arielle, Tovar-Herrera Omar Eduardo, Savary Olivier, Peidro-Guzmán Heidy, González-Abradelo Deborah, Jackson Stephen A., Dobson Alan D.W., Sánchez-Carbente María del Rayo, Jorge Luis Folch-Mallol, Leduc Roland, Cabana Hubert. (2017). Simple screening protocol for identification of potential mycoremediation tools for the elimination of polycyclic aromatic hydrocarbons and phenols from industrial effluents. Journal of Environmental Management. 198 pp. 1-11. http://dx.doi.org/10.1016/j.jenvman.2017.05.010 ISSN: 0301-4797.
  • Fernández-López Maikel Gilberto, Popoca-Ursino Carolina, Sánchez-Salinas Enrique, Raunel Tinoco-Valencia, Jorge Luis Folch-Mallol and Ma. Laura Ortiz-Hernández. (2017). “Enhancing methyl parathion degradation by the immobilization of Burkholderia sp. isolated from agricultural soils” Microbiology Open. En prensa. ISSN: 2045-8827
  • Avelar M., Olvera C., Aceves-Zamudio D L., Folch J.L. and Ayala M. (2017) Recombinant expression of a laccase from Coriolopsis gallica in Pichia pastoris using a modified α-factor preproleader. Protein Expression and Purification. 136 14-19. DOI: 10.1016/j.pep.2017.06.001 ISSN: 1046-5928

Colaboraciones

  • Dra. Verónica Lira Ruan. (CIDC-UAEM)
  • Dr. Ramón Alberto Batista-García (CIDC-UAEM)
  • Dra. Nina Pastor Colón (CIDC-UAEM)
  • Dra. Marcela Ayala Aceves. IBT, UNAM
  • Dra. Claudia Martínez del IBT UNAM
  • Dr. Alfredo Herrera-Estrella del LANGEBIO, Cinvestav Irapuato
  • Dr. Jorge Aburto Anell (IMP)
  • Dra. Helena Porta Ducoing IBT-UNAM
  • Dra. Raquel Cossio Bayugar. INIFAP
  • Dr. Daniel Padilla Chacón Colegio de Posgraduados Chapingo