La Facultad de Ciencias, establecida en 1993, es la institución de origen del Centro de Investigación en Ciencias. Fue creada con la idea de ser un semillero de investigación y enseñanza interdisciplinarias, respondiendo a la necesidad del país de fomentar la formación de recursos humanos en ciencias y tecnología. La transición de Facultad a Centro fue aprobada el 12 de diciembre del 2014.
